2016年是“十三五”开局之年和科技计划管理改革过渡期的最后一年，也是新旧计划体系衔接和新机制磨合的关键之年。在后面的计划管理改革工作中，将更加注重发挥部门作用，总结经验、加强前瞻性研究，主动谋划、提前布局，重点做好五方面工作，一是要把握改革节奏，更加注重全面统筹推进改革；二是要优化任务布局，更加注重自上而下的主动部署；三是既要做好立项，更要做好过程管理，提升创新绩效，注重科研质量；四是要完善规章制度，更加注重管理细节；五是要加强主动服务，更加关注和响应科技界的诉求。
　　在2016年中，将围绕“十三五”科技规划的制定落实，更加充分发挥新机制下科技资源统筹配置和部际联席会议各个成员单位的优势，严格按照64号文件的精神和中央改革办的要求，在三年过渡期内完成国家科技计划管理的全部主体改革任务，将科技计划优化整合、专业机构改建、监督评估体系和计划管理信息系统建设等工作齐抓并进，加快形成计划管理新常态，通过国家科技计划管理改革任务的不断落实，尽早建立完善新型计划管理体系，提高国家科技计划的创新供给质量和效率。